التداخل الجيني عملية تفاعل زوجين من الجينات أو أكثر مع بعضهما بعضا لإظهار صفة معينة. ويحدث التداخل عند تحكم عدد من الجينات في إنتاج الإنزيمات المسؤولة عن مراحل تكوين مادة ما. فمثلا، في حالة تكوين بروتين معين يتحكم في مسار بنائه ثلاثة أزواج من الجينات، فإن وجود أحد هذه الأزواج بصورة متنحية سيؤدي إلى توقف عملية البناء. ويسمى مثل هذا الجين جينا متفوقا epistatic gene ، ويعرف بأنه : "جين يمنع ظهور أثر جين آخر غير مقابل له يسمى جينا غير متفوقا. ويمكن تعريف التفوق الجيني بأنه : "عملية منع ظهور أثر جين بجين متفوق غير مقابل له" ، وقد يكون الجين المتفوق سائدا، وفي هذه الحالة يكفي جين سائد واحد لمنع ظهور أثر جين آخر غير مقابل له. ويجب عدم الخلط بين السيادة والتفوق، فالسيادة التّامة هي منع جيبن معين ظهور أثر جين مقابل له في الموقع نفسه على الكروموسوم المماثل. وبمعنى آخر، فإن السيادة هي تفاعل الجينات المتقابلة الواقعة في الموقع الكرموسومي نفسه، والمتحكمة بالصفة نفسها مع بعضها بعضا. لكن التفوق الجيني هو تفاعل جينات غير متقابلة تقع في مواقع مختلفة من الكروموسوم نفسه أو كرموسوم آخر.
ومن الأمثلة على التداخل الجيني، تداخل أثر الجينات المسؤولة عن لون ثمار نبات القرع الصيفي. إذ إن جين صفة اللون الأصفر G سائد على جين صقة اللون الأخضر g ، والجين C الذي يمنع تكوين اللونين الأصفر والأخضر، سائد على الجين c الذي يسمح بتكوين أحد اللونين ثمار بيضاء. ولكن، إذا اجتمع الجينان المتنحّيان cc مع الجين G تظهر صفة اللون الأصفر، وإذا اجتمع الجينان cc مع الجينين gg تظهر صفة اللون الأخضر. ولمعرفة نسب الطرز الجينية والطرز الشكلية للأفراد الناتجة من تلقيح نباتي قرع غير نقيين للصفتين المذكورتين.
لاحظ أن نسبة الطرز الشكلية للأفراد الناتجة، هي: 12 نباتا أبيض الثمار : 3 نباتات صفراء الثمار : نبات واحد أخضر الثمار.
